Територіальні накази
Існувало три відносних принципу, за яким розподілялися повноваження наказів. Це категорії населення, території або напрямки роботи. Виходячи з цього, можна виділити кілька груп наказів. У віданні територіальних знаходилося управління окремими округами, князівствами. Деякі з них носили назву «чверті» (існував у XV столітті принципом поділу земель Московського князівства):
- Нижегородська.
- Володимирська.
- Новгородська.
- Устюзький.
- Галицька.
- Костромська.
По мірі приєднання або втрати нових територій створювалися і об’єднувалися нові накази: Великоросійський, Сибірського, Казанського Палацу, Малоросійський, Лифляндских справ та ін.
Палацові
Якщо у віданні першої групи наказів перебували цілі регіони, то до цієї категорії відносилися відомства, в обов’язок яких ставилося управління державним двором і землями. Початок було покладено створенням наказу Великого палацу. Керівництво їм доручалося «дворецькому», керував придворними. Однією з найважливіших його завдань було збирання оброку та інших податків з населення міст, сіл, волостей, що належали царської родини. В цю наказову систему згодом також увійшли:
- Казенний.
- Хлібний.
- Стаєнний.
- Ловчий.
- Постільний.
- Сокольничий.
- Палацовий судний.
- Кам’яний.
- Панихидный.
- наказ Золотого і срібного справи.
- Царська і Царицина майстерні палати.