Орнітофауна
Устюртский заповідник відрізняється багатим світом пернатих. Загальне число зареєстрованих тут видів птахів – 166. Третина з них постійно гніздиться на території заповідника. Вісім видів занесені до Червоної книги Казахстану. В числі об’єктів охорони Устюртського заповідника – фламінго, балобан, сапсан, беркут, степовий орел.
Численні ніші, тріщини і виїмки в чинках Устюрта, недоступні для хижаків, є улюбленим місцем гніздування для цілого ряду птахів. Найчастіше такі місця облюбовують ворони, пугачі, стерв’ятники та сичі. Велику небезпеку для пернатих мешканців заповідника представляють лінії електропередач. Щорічно гинуть кілька десятків птахів, в тому числі і червонокнижні хижаки.
Повзаючих і стрибає фауна
Рептилії (або плазуни) – типові мешканці будь-пустельної місцевості. В межах Устюртського заповідника таких налічується 18 видів. Найбільш численні серед них – степова агама, ящурка швидка, стріла-змія. Досить широко поширені гекони (зокрема, сірий і каспійський). Однак через сутінкового способу життя останніх побачити їх досить складно.
Цікавий мешканець Устюрта – піщаний удавчик. Зменшено-лагідний суфікс до назви цього виду додано невипадково: змія і справді відрізняється невеликими розмірами. Однак вона так само душить своїх жертв – дрібних гризунів, ящірок і птахів, як і її більш великі тропічні родичі. Ще один цікавий представник тутешньої фауни – зелена жаба. Від денної спеки вона ховається в глибоких норах, а на полювання виходить лише вночі. Розмножується в суворо визначених і рідкісних місцях, там, де на поверхню виступають грунтові води.
