Цунамі
Збожеволілі від страху жителі, яким вдалося уникнути долі бути похованими під уламками будинків, кинулися до набережної. Вони сподівалися знайти своє спасіння в море і піти з міста на кораблях. Але тут їх чекала смерть від іншої стихії – приблизно через 20 хвилин на берег нахлинула величезна хвиля цунамі, згенерована вогнищем землетрусу в море. Її висоту оцінюють в 6-15 м.
Після обрушилася водяної гори лісабонська набережна обвалилася і поховала разом з собою людей, що скупчилася на ній. За деякими свідченнями, після другого великого підземного поштовху на прибережній ділянці виник великий зсув. Це сталося близько 10 ранку. Сучасні дослідження показують, що в лісабонській бухті в той день відбулися великі підводні обвали.
Пожежі
Лиха, що обрушилися на жителів міста, не обмежилися підземних поштовхів і цунамі. Коли сталося лісабонську землетрус, у багатьох місцях почалися пожежі, які швидко переросли у велику пожежу. Вогонь руйнував залишки міста протягом 5 днів, руїни тліли ще стільки ж.
Сучасники події бачили причину пожежі в тому, що в День Всіх Святих в церквах і молельнях горів вогонь, який поширився по місту з-за сильного вітру. Однак існують і інші гіпотези. Так як на території міста утворилися глибокі тріщини в земній корі, то за ним з надр міг надходити горючий газ. Його займання і призвело до появи численних джерел відкритого вогню, який ніяк не вдавалося загасити. На користь цієї версії говорить і той факт, що через 100 років після страшної події тут були виявлені радіоактивні елементи. Вони могли вийти на поверхню землі разом з горючим газом.
