Після Громадянської війни
В СРСР Микола Котов закінчує вищі курси, ад’юнктури, стає начальником штабу військової академії імені Фрунзе. Після цього несподівано опиняється в Липецьку, головою льотно-тактичної школи. Це можна розцінити як істотне пониження в посаді.
По всій видимості, комдив вже тоді опинився в опалі, яка через кілька років закінчилася арештом і розстрілом.
Виклик до Москви
Біографія Миколи Котова закінчується трагічно. Влітку 1936 року його викликають у Москву, натякнувши, що розглядається його переклад в Ленінградський військовий округ і призначення на більш престижну посаду. В дорозі його заарештовують.
Сьогодні, завдяки зусиллям його нащадків, стали відомі обставини цієї справи. Котова звинуватили в шпигунстві на користь Німеччини, в участі у фашистській змові, метою якого було відновлення капіталізму і повалення соціалістичного ладу. Миколи Яковича підозрювали у шкідницькій і підривній діяльності, яку він нібито вів у Червоній армії.
З матеріалів допитів випливає, що Котів не приховував свого критичного ставлення про стан справ у радянських військах. Свої свідчення він закінчує висновком, що авіація не готова до війни.
Комдив був розстріляний в самому початку 1938 року. Суд тривав тільки один день. Слідом практично одразу заарештували дружину Марію, доньку Ірину та сина Володимира. Всі вони були засуджені до тривалих термінів.
Ірина та Марія були звільнені у 1946 році, після чого змогли повернутися до Липецька. Володимир у 1942-му був переведений в штрафний батальйон, після отримання поранення судимість з нього була знята.
