Комбінований
Цей вид мікроскопа використовує один з об’єктивів (як правило, третій) поруч з об’єктом для збору світла навколо нього. Він фокусує реальне зображення всередині мікроскопа. Потім вона збільшується з допомогою другої лінзи або групи лінз (званих окуляром), що дає глядачеві можливість побачити перевернуту віртуальну версію об’єкта. Використання комбінації об’єктиву/окуляра дає змогу значно збільшити його. Професійні біологічні мікроскопи цього виду часто мають змінні об’єктиви, що дозволяють користувачеві швидко регулювати збільшення. Комбінований мікроскоп також забезпечує більш просунуті налаштування освітлення, такі як фазовий контраст.
Стерео
Стерео, стереоскопічний або розсікає мікроскоп являє собою варіант оптичного мікроскопа, призначений для спостереження з малим збільшенням зразка, зазвичай використовуючи світло, відбите від поверхні об’єкта, а не переданий через нього. Прилад застосовує 2 окремих оптичних шляху з двома об’єктивами і окулярами, щоб забезпечити дещо різні кути огляду в лівому і правому очах.
Ця компоновка дає тривимірну візуалізацію досліджуваного зразка. Стереомикроскопия перекриває макрофотографию для реєстрації та дослідження твердих зразків зі складною топографією поверхні, де для аналізу деталей потрібно тривимірне уявлення.
Стереомикроскоп часто використовується для вивчення поверхонь твердих зразків або для проведення близьких робіт, таких як диссекція, мікрохірургія, виробництво годинників, виготовлення друкованих плат, а також огляд поверхні тріщин, як при фрактографии, так і в судовій техніці. Таким чином, вони широко використовуються в обробній промисловості або для виробництва, визначення складу сировини і контролю якості. Стереомікроскопи є важливими інструментами в ентомології.
Стереомикроскоп не слід плутати з складовим аналогом, оснащеним двома окулярами і биновивером. У такому професійному мікроскопі обидва ока бачать одне і те ж зображення, причому два окуляра служать для забезпечення більшої зручності перегляду. Однак зображення в такому пристрої нічим не відрізняється від візуалізації, отриманої за допомогою одного монокулярного апарату.
