У Москві
У 1925 році Олександр Олександрович приїхав в столицю для роботи у Другому Московському університеті в якості завідувача кафедри патофізіології медфаку. Пізніше брав участь у створенні першого в усьому світі Інституту переливання крові та гематології, який очолив А. А. Богданов. Після смерті директора Богомолець зайняв його посаду. Під керівництвом ученого був розроблений унікальний метод консервації донорської крові, який застосовується до цих пір без принципових змін. У той же час Олександр Олександрович зі своїми учнями виявив універсальність першої групи крові в плані донорства.
У Москві Богомолець написав багато наукових робіт, серед яких можна виділити «Загадку смерті» і «Криза ендокринології» 1927 р., «Набряк. Нарис патогенезу» та «Про вегетативних центрах обміну» 1928 р., «Артеріальну гіпертонію» 1929 р. доктор медицини значно розширив і переробив підручник «Патологічна фізіологія», в 1929 р. вийшов його третє видання.
