Відставка
У 1798 році в імператриці з’явилося багато ворогів, наприклад, граф Федір Васильович Ростопчина і граф Іван Павлович Кутайсов. Вони зуміли вселити Павлу I, що дружина має над ним дуже великий вплив, чого не може собі дозволяти російський цар. Кутайсов і Ростопчина стверджували, що Марія Федорівна діє заодно зі своєю камер-фрейліною Нелидовой. В результаті Катерину Іванівну замінили більш юною, чутливої і молодий Ганною Петрівною Лопухіної. Незабаром вона перетворилася в нову улюбленицю імператора.
Як тільки Лопухіна остаточно переїхала до столиці, відбулася офіційна відставка Катерини Нелидовой. Вона пішла в Смольний монастир.
Життя в монастирі
Незабаром після цього вона на собі відчула немилість російського правителя, якого вважала сердечним другом. Імператор був незадоволений її активним заступництвом за дружину, яку розраховував також видалити від двору, відправивши у посилання в Холмогори. Це село на території сучасної Архангельської області.
Нелідова виїхала з Петербурга після того, як зі столиці була вислана її улюблена подруга графиня Буксгевден. Вона була відправлена в эстляндский замок Лоде, що знаходиться в межах нинішніх кордонів Естонії. У 1798 році Нелідова поїхала в Ревель (зараз це місто називається Таллінн, столиця Естонії).
Тільки через півтора року вона попросила дозволу повернутися на постійне місце проживання в Смольний монастир.
Смерть Павла I сильно потрясла Нелидову. Розповідають, що вона буквально посивіла і постаріла в лічені дні. При цьому з імператрицею, вона зберегла дружні відносини, які підтримувала до смерті Марії Федорівни. Більше того, її голос мав певну вагу при вирішенні питань у справах царської сім’ї. У 1801 році вона повернулася в Санкт-Петербург, почавши допомагати імператриці в керівництві виховними установами.
