Мілина
Береги затоки оточує широка мілину, глибини якої складають менше 20 метрів. Найбільш великий острів – Моржовец – лежить на мілині біля південного берега Мезенської губи. Берегова частина мілини піддається безперервної осушення. Найбільша ширина осушення спостерігається біля східного берега.
Південний берег
Абрамовський берег простягнувся на 39 миль в напрямку WNW (вест-норд-вест) від порту Мезен до мису Воронова. Місцями його відрізняють височини і обриви, місцями зустрічаються і низовини. Подекуди поверхня берега вкрита низькорослим лісом. Найбільш отмелым є ділянка між мисами Юроватым і Нерпинским. Тут мілина з безліччю глибин менше 5 метрів тягнеться від берега на відстань, що досягає дев’яти миль. На північ від цієї мілини лежать великі, осыхающие (частково) банки. Цей мілководний район, тягнеться на північ від берега на відстань близько 20-22 милі, називається Абрамовським мілководдям. На захід від мису Юроватого берег стає приглубым. Уздовж Абрамовського берега до порту Мезень проходить Південний Мезенський фарватер, глибина якого досягає семи – десяти метрів.
