Діяльність у сфері освіти
У 1839 році Ян Пуркіньє відкрив фізіологічний інститут в Бреслау, який був першим подібним закладом в світі. Він став деканом медичного факультету, обраний на цю посаду чотири рази поспіль. В 1850 році він став професором фізіології в університеті Праги. Там він зосередився на повернення до використання чеської мови замість німецької в діяльності університету.
Він виявив значне зниження чутливості людського ока при тьмяному червоному світлі порівняно з аналогічним блакитним. Він опублікував дві книги: “Спостереження і експерименти, що досліджують фізіологію почуттів” і “Нові суб’єктивні звіти про зорі”, які посприяли появі науки експериментальна психологія.
Він створив першу у світі кафедру фізіології в Університеті Бреслау в Пруссії (нині Вроцлав, Польща) в 1839 році і першу в світі офіційну фізіологічну лабораторію в 1842 році. Тут він був засновником літературно-слов’янського товариства.
