Розташування атомів
З’єднання в пептидах білків коротше, ніж в інших пептидних групах, так як вона володіє частковою характеристикою зв’язку подвійний. Враховуючи, що таке пептидний зв’язок, можна зробити висновок про малу її рухливості.
Електронне побудова пептидного зв’язку задає тверду плоску структуру групи пептидів. Площині таких груп розташовуються один до одного під кутом. Зв’язок між атомом a-вуглецю і групами a-карбоксильної і a-аміногрупою може провертатися по своїй осі вільно, при тому, що обмежена розміром і характером радикалів, а це дає можливість для поліпептидного ланцюжка задавати собі різні налаштування.
Пептидні зв’язки в білках, як правило, знаходяться в транс-конфігурації, тобто розташування атомів a-вуглецю розміщується в різних частинах групи. Результатом є розташування бічних радикалів у амінокислот на більш віддаленій відстані у просторі один від одного.
