Протягом перших кількох років свого існування держава прагнула бути визнаним єдиним правонаступником Югославії, але проти цих претензій виступили інші колишні союзні республіки. Організація Об’єднаних Націй відхилила прохання включити до складу Югославії. Зрештою, після повалення режиму Слободана Мілошевича з посади президента федерації в 2000 році країна відмовилася від цих прагнень і прийняла думку Арбітражного комітету Бадинтера про спільне правонаступництво. Він знову подав заявку на членство в ООН 27 жовтня і був прийнятий 1 листопада 2000 року.
Керівництво
В СРЮ спочатку правил Слободан Мілошевич в якості президента Сербії (1989-1997 рр..), а потім президента Югославії (1997-2000 рр). Мілошевич встановив і змусив змістити кількох федеральних президентів (таких, як Добриця Чосич) і прем’єр-міністрів (таких, як Мілан Паніч). Однак чорногорське уряд, спочатку палко підтримувало Мілошевича, почало поступово дистанціюватися від його політики. Це призвело до зміни режиму в 1996 році, коли його колишній союзник Мило Жуканович змінив свою політику, став лідером правлячої партії Чорногорії і згодом звільнив колишнього чорногірського лідера Момира Булатовича, який залишався лояльним уряду Мілошевича. Оскільки з того часу Булатовичу були призначені центральні пости в Белграді (в якості федерального прем’єр-міністра), Жуканович продовжував керувати Чорногорією і надалі ізолював її від Сербії. Таким чином, з 1996 по 2006 рр. Чорногорія і Сербія були номінально єдиною країною. Управління в кожному можливому політичному, економічному і соціальному сегменті здійснювалося на місцевому рівні, в Белграді для Сербії і для Чорногорії Подгориці.
